Η Ιστορική Συλλογή περιλαμβάνει νομίσματα, όπλα, όπως πιστόλες, τουφέκια και κρητικά μαχαίρια. Επίσης επαναστατικές σημαίες και χαρτογραφικές αποτυπώσεις της Κρήτης, τεκμήρια από την Οθωμανική παρουσία στο νησί, από την εποχή της Αυτονομίας και τη Ρώσικη παρουσία στο Ρέθυμνο, μέχρι τον Βενιζέλο και την ένωση της Κρήτης με τη Ελλάδα. Ακόμα περιλαμβάνει τεκμήρια Κρητών από τον Α΄ Παγκόσμιο Πόλεμο, τον Μακεδονικό Αγώνα, καθώς και τη Μάχη της Κρήτης και τη Γερμανική κατοχή.
Μάχη της Κρήτης 20-29 Μαΐου 1941
Από τα μεγαλύτερα γεγονότα του Β’ Παγκοσμίου πολέμου θεωρείται η θρυλική “Μάχη της Κρήτης”, το τελευταίο δεκαήμερο του Μαΐου το 1941.
Η επική αντίσταση των υπερασπιστών του νησιού, του άμαχου πληθυσμού ανδρών και γυναικών κατά των Γερμανών εισβολέων, κίνησε τον παγκόσμιο θαυμασμό. Οι Γερμανοί αναγκάστηκαν να διαθέσουν στην Κρήτη τεράστιες δυνάμεις. Οι απώλειές τους σε ανθρώπους και υλικό υπήρξαν τρομακτικές. Το θεωρούμενο ως αήττητο όπλο των αλεξιπτωτιστών δεν χρησιμοποιήθηκε ποτέ πια σε μεγάλες επιχειρήσεις. Περισσότεροι από 4.000 αλεξιπτωτιστές είναι θαμμένοι στο Γερμανικό νεκροταφείο του Μάλεμε. Οι Κρήτες για μίαν ακόμα φορά πολέμησαν ηρωικά, βάζοντας πάνω από τη ζωή τους την πατρίδα και την ελευθερία τους.
